他們同屬于光學顯微鏡，不同的 是光路方向不同，物鏡與照明系統顛倒。

普通光學顯微鏡是正置的也就是物鏡在觀察試片的上方，這種顯微鏡非常適合用來觀測玻片標本，試片需要切片觀察。

所以也叫做切片顯微鏡，缺點就是無法觀察移動活細胞，倒置生物顯微鏡的物鏡是在待測物的下方可應用于觀察透明培養皿活的標本不受標本高度的限制；可搭配相位差觀察模式即可實現無需染色也可觀察兩種類型的顯微都可以直接直接切換到成像系統將觀察到的圖像保存下來。也可以使用顯微圖像分析系統實時的統計分析