光學顯微鏡和電子顯微鏡在多個方面存在顯著差異：

照明源：光學顯微鏡使用可見光作為照明源，而電子顯微鏡使用電子槍發出的電子流作為照明源。由于電子流的波長遠短于光波波長，電子顯微鏡的分辨率顯著高于光學顯微鏡。

透鏡：光學顯微鏡使用玻璃磨制而成的光學透鏡，而電子顯微鏡使用電磁透鏡。電磁透鏡由環形電磁線圈組成，能在中央部位產生磁場，其功能相當于光學顯微鏡中的聚光鏡、物鏡和目鏡。

成像系統：光學顯微鏡利用凸透鏡的放大成像原理來放大樣本成像，而電子顯微鏡則是利用電子束穿透樣本后再由透鏡放大成像。

放大倍數和分辨率：光學顯微鏡的放大倍數一般在2000x左右，而電子顯微鏡的放大倍數可高達數十萬倍。由于電子顯微鏡的照明源和透鏡的特性，其分辨率遠高于光學顯微鏡。

應用領域：光學顯微鏡由于其較低的放大倍數和分辨率，通常用于觀察表面微細結構。而電子顯微鏡則可以觀察晶體結構、微細組織、化學組成和電子分布情況等，因此廣泛應用于生物學、醫學、農業、制藥等領域。

總的來說，光學顯微鏡和電子顯微鏡在多個方面存在顯著差異，需要根據實際需求進行選擇。